Ngày 18/8/2014, Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường đã ban hành Quyết định số 1736/QĐ-BTNMT phê duyệt Bộ Chỉ số theo dõi, đánh giá cải cách hành chính của các tổng cục, cục trực thuộc Bộ. Bộ Chỉ số CCHC giúp theo dõi, đánh giá một cách thực chất, khách quan và công bằng kết quả thực hiện CCHC hàng năm của các tổng cục, cục trực thuộc Bộ.
Chỉ số CCHC bám sát nội dung Chương trình tổng thể CCHC của Bộ giai đoạn 2012 – 2020 ban hành kèm theo Quyết định số 2198/QĐ-BTNMT ngày 12/12/2012 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường; bảo đảm tính khả thi, phù hợp với đặc điểm, điều kiện thực tế của các tổng cục, cục trực thuộc Bộ và đánh giá thực chất, khách quan kết quả thực hiện CCHC theo chu kỳ năm ở các đơn vị; có sự tham gia đánh giá của cá nhân, tổ chức và các đơn vị liên quan của Bộ đối với quá trình thực hiện công tác CCHC của các tổng cục, cục; hình thành được hệ thống theo dõi, đánh giá đồng bộ, thống nhất.
Chỉ số CCHC được xác định trên 7 lĩnh vực, 34 tiêu chí và 92 tiêu chí thành phần. 7 lĩnh vực bao gồm: công tác chỉ đạo, điều hành CCHC; xây dựng và tổ chức thực hiện thể chế thuộc phạm vi quản lý nhà nước của bộ; cải cách thủ tục hành chính; cải cách tổ chức bộ máy hành chính nhà nước; xây dựng và nâng cao chất lượng đội ngũ công chức, viên chức; đổi mới cơ chế tài chính đối với cơ quan hành chính và đơn vị sự nghiệp công lập; hiện đại hóa hành chính.
Bộ Chỉ số CCHC có thang điểm đánh giá là 100, trong đó, điểm tự đánh giá của đơn vị là 80 và điểm đánh giá qua điều tra xã hội học là 20. Trong phần tự đánh giá của đơn vị, các tổng cục, cục tự theo dõi, đánh giá và cho điểm kết quả thực hiện nhiệm vụ CCHC của đơn vị và các tổ chức trực thuộc theo các tiêu chí, tiêu chí thành phần được quy định và sẽ được Hội đồng thẩm định Chỉ số CCHC xem xét, công nhận hoặc điều chỉnh. Đối với phần đánh giá thông qua điều tra xã hội học, số tiêu chí, tiêu chí thành phần đánh giá qua lấy phiếu điều tra là 12 và do Vụ Tổ chức cán bộ thực hiện. Việc điều tra xã hội học được tiến hành lấy ý kiến đánh giá của các nhóm đối tượng khác nhau trong Bộ TN&MT và Sở TN&MT. Tổng hợp điểm qua lấy phiếu điều tra và điểm Hội đồng thẩm định Chỉ số CCHC sẽ là điểm căn cứ để tính Chỉ số CCHC cho từng đơn vị.
Để Bộ Chỉ số CCHC phát huy hiệu quả một cách đồng bộ, Bộ TN&MT cũng yêu cầu thủ trưởng các đơn vị cần chỉ đạo thực hiện tốt các nội dung như: nâng cao trách nhiệm và hiệu quả chỉ đạo, điều hành của các đơn vị đối với việc xác định Chỉ số CCHC; tăng cường công tác tuyên truyền, phổ biến về Chỉ số CCHC; bố trí công chức thực hiện thường xuyên công tác theo dõi, đánh giá cải cách hành chính tại các đơn vị; bảo đảm cơ sở vật chất, tài chính để thực hiện đánh giá Chỉ số CCHC.