Ngày 08/01/2016, Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường (TN&MT) đã ban hành Quyết định số 839/QĐ-BTNMT thành lập Ban soạn thảo, Tổ biên tập xây dựng Nghị định của Chính phủ quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật khí tượng thuỷ văn với sự tham gia của đại diện Bộ Tư pháp, Văn phòng Chính phủ, Bộ Quốc phòng, Bộ Công an, Bộ Ngoại giao, Bộ Tài chính, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Bộ Giao thông Vận tải, Bộ Xây dựng, Bộ Thông tin – Truyền thông, Bộ Công Thương, Văn phòng Quốc hội, một số đơn vị thuộc Bộ TN&MT và các chuyên gia. Bộ TN&MT đã tổ chức triển khai xây dựng Nghị định của Chính phủ quy đinh chi tiết thi hành một số điều của Luật khí tượng thuỷ văn theo trình tự quy định của pháp luật ban hành văn bản quy phạm pháp luật, cụ thể đã đánh giá tác động của dự thảo Nghị định của Chính phủ quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật khí tượng thuỷ văn; Rà soát, nghiên cứu các văn bản quy phạm pháp luật có liên quan, đặc biệt là các văn bản pháp luật chuyên ngành thuộc các lĩnh vực liên quan tới Nghị định như giao thông vận tải, công thương, xây dựng, quản lý, bảo vệ phát triển rừng, đê điêu, tài nguyên nước, phòng, chống thiên tai, thông tin truyền thông; các điều ước quốc tế về khí tượng thủy văn mà Việt Nam là thành viên... để đảm bảo không chồng chéo, xung đột giữa các quy định, tuân thủ các cam kết của Việt Nam đối với quốc tế; Tổ chức nghiên cứu, vận dụng các quy định, khuyến cáo kỹ thuật về khí tượng thủy văn liên quan của Tổ chức Khí tượng Thế giới (WMO), Tổ chức Hàng không dân dụng quốc tế (ICAO); Tổ chức các hội thảo khoa học, họp Ban soạn thảo, Tổ biên tập đóng góp cho dự thảo với sự tham gia của đại diện của các Bộ, ngành, các chuyên gia; Xin ý kiến bằng văn bản của các Bộ, ngành, Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam, các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; đăng website Cổng Thông tin điện tử Bộ để xin ý kiến toàn dân từ ngày 26/2/2016. Đến nay, đã có 10 Bộ, ngành, Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam, Liên hiệp các Hội khoa học kỹ thuật Việt Nam, 57 tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có ý kiến góp ý đối với dự thảo Nghị đinh.
Theo đó, Dự thảo Nghị định gồm 3 Chương với 37 Điều, trong đó: Chương I về Quy định chung (Điều 1 và 2) quy định về phạm vi điều chỉnh và đối tượng áp dụng; Chương II về Quy định chi tiết (gồm 5 mục từ Điều 3 đến Điều 34) quy định chi tiết về 5 nhóm nội dung tại một số điều, khoản trong Luật Khí tượng thủy văn; Chương III về Tổ chức thực hiện (gồm Điều 35 và 36), trong đó có quy định Nghị định có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01/7/2016.