Theo đánh giá của Tổng cục Môi trường (Bộ TN&MT), mức độ ô nhiễm này còn có thời điểm lên đến 400 lần (chủ yếu ở hạ lưu), trong khi nguồn nước thải từ các khu công nghiệp, nước thải sinh hoạt và các loại chất thải nguy hại khác từ các khu đô thị, cơ sở sản xuất, y tế… vẫn hằng ngày đổ xuống mà chưa được xử lý. Tính đến hết năm 2012, trên địa bàn TP. đã có tới 35/37 cơ sở gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng (chiếm tỷ lệ 94,6%), trong khi 2 cơ sở còn lại là Nhà máy xi măng Hà Tiên (quận 9) và Nhà máy đóng tàu Ba Son (quận 1), dù có khắc phục ô nhiễm nhưng chưa triệt để.
Trong 5 năm vừa qua (2007 - 2012), trên lưu vực sông Sài Gòn (địa phận TP. Hồ Chí Minh), đã có 9 dự án hạ tầng xử lý nước thải, bảo vệ môi trường được thực hiện, gồm: Dự án cải thiện môi trường nước TP. lưu vực kênh Tàu Hủ - Bến Nghé (giai đoạn 2); vệ sinh môi trường lưu vực Nhiêu Lộc - Thị Nghè; nạo vét luồng Soài Rạp (giai đoạn 2); giảm thất thoát nước và tăng cường mở rộng mạng lưới cấp nước 2010 - 2015… Thế nhưng, phần lớn các dự án trên vẫn chưa hoàn thành và có dự án phải kéo dài đến năm 2017 do thiếu vốn (vốn đầu tư nước ngoài chủ yếu).
Thanh Bình