Thời gian qua, đề án đã hoàn thành một khối lượng lớn công việc: thực hiện 18/20 dự án điều tra cơ bản TN-MT biển, từ đó tạo lập được hệ thống dữ liệu có độ tin cậy cao về điều kiện tự nhiên và TN-MT vùng biển và ven biển Việt Nam. Đề án cũng đã xây dựng được các trung tâm ứng phó sự cố tràn dầu ở cả 3 miền Bắc, Trung, Nam; đang hoàn thiện hệ thống tiêu chí về đánh giá mức độ tổn thương TN-MT biển trên một số vùng trọng điểm (như các khu vực giàn khoan); đo vẽ lập bản đồ, đánh giá mức độ tổn thương TN-MT biển cho 16 vùng trọng điểm ở tỷ lệ 1/100.000 và 1/50.000. Xây dựng quy hoạch, chiến lược phát triển kinh tế vùng biển và ven biển Việt Nam…
Phó Thủ tướng Hoàng Trung Hải chỉ đạo, giai đoạn 2012 - 2020 của đề án phải đạt được mục tiêu đẩy mạnh hơn nữa công tác điều tra cơ bản điều kiện tự nhiên, tài nguyên thiên nhiên và môi trường vùng biển Việt Nam; xác lập được luận cứ khoa học, cơ sở pháp lý để tăng cường quản lý Nhà nước, phát huy tiềm năng, lợi thế của vùng biển và ven biển; thực hiện nhiệm vụ phát triển bền vững, tăng cường quốc phòng, an ninh, bảo đảm chủ quyền an ninh quốc gia…